Το 2012 ο Γιάννης Βαρδής παντρεύτηκε την επί 13 χρόνια σύντροφό του Φιλοθέη Μαρία Μωβ με μόνους μάρτυρες τα παιδιά του, Γιάννη και Καλλιστώ Βαρδή.
Σύμφωνα με εβδομαδιαία εφημερίδα οι σχέσεις όλων ήταν πολύ καλές ακόμα και μετά το θάνατο του μεγάλου τραγουδιστή. Η σύντροφός του εξακολουθούσε να ζει στο ισόγειο του κτίσματος.
Παρόλα αυτά στις 4 Φεβρουαρίου η σύζυγος του τραγουδιστή έλειψε για λίγο για να αγοράσει τροφές για τα σκυλιά τους και όταν επέστρεψε δεν είχε πρόσβαση στις πόρτες. Τα δυο παιδιά του τραγουδιστή είχαν αλλάξει κλειδαριές και η ίδια εξήγησε το λόγο λέγοντας:
Είπε ότι το έκανε αυτό (Γιάννης Βαρδής) γιατί δήθεν είχα συνομιλήσει με τράπεζα στη Βουλγαρία, στην οποία διατηρούσε κοινό τραπεζικό λογαριασμό με τον πατέρα του και ότι για τον λόγο αυτό δεσμεύτηκε ο λογαριασμός και αδυνατούσε να εκμαιεύσει χρήματα… Παρά τις διαβεβαιώσεις μου ότι ουδέποτε είχα επικοινωνήσει με την βουλγαρική τράπεζα ο Γιάννης αρνήθηκε να μου επιτρέψει την είσοδο στην κατοικία μου.
Η σύζυγος και τα δυο παιδιά του τραγουδιστή βρίσκονται πλέον σε δικαστική διαμάχη με την πρώτη να καταθέτει ασφαλιστικά μέτρα στις 16 Φεβρουαρίου και μια μήνυση τη Μεγάλη Τετάρτη για αυτοδικία.